在本届大会上,苏州大学附属儿童医院胡绍燕教授及其团队成员报告了6项研究。《肿瘤瞭望-血液时讯》特邀请胡绍燕教授及其团队成员以圆桌会的形式和广大读者分享他们关于allo-HSCT与CAR-T细胞治疗在儿童白血病患者中的疗效与安全性的研究成果,并针对这6项研究进行精彩述评。
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宏基因组下一代测序在儿童患者中因CAR-T治疗导致的HIV核酸检测假阳性:病例报道
讲者:周密
背景
慢病毒载体常用于工程化CAR-T细胞,但有时可能会导致CAR-T回输后人类免疫缺陷病毒(HIV)出现假阳性的检测结果。然而,识别这种假阳性结果可能会令人困惑。
方法
我们报告了首例在CAR-T治疗后由宏基因组下一代测序(mNGS)检测到的假阳性HIV-1病例。我们分析了一例被诊断为B细胞急性淋巴细胞白血病的五岁男孩的病例。该儿童患者在CAR-T回输后第3天出现细胞因子释放综合征(CRS)和与CAR-T细胞相关的脑病综合征(ICANS)。由于CRS和脓毒症的区分难度较大,因此对血液和脑脊液样本进行了mNGS检测。脑脊液和血液的mNGS均检出HIV-1 DNA序列。
结果
检测到的DNA序列仅覆盖了HIV基因组的部分位点(如图1所示)。同时,通过血液宏转录组测序(RNA-seq)未检测到HIV序列。通过高敏感度的HIV-1 RNA检测试验阴性,以及病史中多次重复的基于HIV抗体的免疫测定法证实其为假阳性的结果。该患者未启动抗HIV治疗。我们还利用mNGS提取了HIV检出的部分基因组序列以进行后续分析。
图3.检测到的DNA序列仅覆盖了HIV基因组的短片段
结论
多项研究报告了CAR-T治疗后检出假阳性HIV的情况。这些研究使用了核酸扩增技术(NAAT)进行检测,但由于商业机密,关于CAR-T产品中使用的具体载体类型的信息有限。与NAAT相比,mNGS提供了可视化方式来表示病原体基因组的覆盖情况,为临床评估提供了更直观、更易于解释的方法。特别是在基因组的大部分未被覆盖的情况下,mNGS可以帮助区分非特异性序列检测和假阳性。如有需要,可以使用生物信息学进一步分析和使用BLAST比较识别的核苷酸序列。mNGS提供全面基因组视图的能力是其相对于NAAT的独特优势,这可以在未来的临床实践中进一步探索。
专家点评
周密:本次会议我和血液科的团队一起报道了一例经过CAR-T治疗之后出现假阳性HIV感染的患者。CAR-T使用慢病毒作为载体,有些患者在CAR-T回输之后会检测到HIV的序列,目前其他国家已经报道过个别病例,都是采用了PCR的检测方法。这例患者CAR-T回输后出现CRS,可能会存在和脓毒症的鉴别诊断的问题,所以我们在临床上使用mNGS作为一种检测感染或排除感染的诊断方法。我们发现有一例患者在mNGS检测的过程中存在HIV序列,同时我们也采用了PCR和其他一些方法,包括患者病史的分析,以证明这种HIV检测的结果是假阳性。我们在临床上可能也会遇到类似的情况出现,也请大家重视。
卢俊教授:周密老师的病例报道对包括ICU、感染科等相关科室的临床医生是很好的一个借鉴。CAR-T治疗后的CRS反应达到了90%以上,引起的发热与严重的炎症因子的感染是不易区别的,可以通过培养或mNGS来检测发现一些病原体。周老师在这个病例中发现了HIV的病毒序列,这通常会引起我们临床医生的疑惑:患者怎么会在CAR-T回输后2~4个月后CRS感染?其实并不是感染,实际上是在CAR-T回输过程中伴随HIV的序列,所以今后遇到这种情况可以得到正确的解释,对我们临床医生有很好的指导作用。